■ FOODTECH CASE STUDY|CASE 1 ■

フードテック・合成生物学3社比較
インテグリカルチャー × ユーグレナ × ちとせ研究所

培養肉(細胞農業)×ミドリムシ(藻類食品)×バイオ産業エコシステム
日本の「バイオものづくり」3モデルの知財戦略対比
Aegis Nova IP Consulting|分析日:2026年4月24日
インテグリカルチャー累計
約19億円
シリーズA'まで
ユーグレナ売上
503.7億円
2025/12期過去最高
ユーグレナ時価総額
約609億円
2025/10時点
CulNet System
特許取得
国内外

Table of Contents

  1. Executive Summary ― 日本発バイオフードテックの3モデル
  2. 論点整理 ― 培養肉・藻類・合成生物学の規制・知財
  3. インテグリカルチャー ― 培養肉のCulNet System
  4. ユーグレナ ― 東証プライム藻類食品リーダー
  5. ちとせ研究所 ― バイオ産業エコシステム構築
  6. 3社比較&ポートフォリオマップ
  7. 追うべきシグナル
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Executive Summary ― 日本発バイオフードテックの3モデル

Thesis

3社は「バイオものづくり」の異なるアプローチを示す

インテグリカルチャー、ユーグレナ、ちとせ研究所は、いずれも日本発のバイオ・フードテック企業だが、対象となるバイオ素材(動物細胞・微細藻類・多様生物)、事業モデル(プラットフォーム・上場企業・エコシステム)、知財戦略が大きく異なる。

CORE THESIS
「培養肉プラットフォーム × ミドリムシ上場企業 × バイオエコシステム構築者」
インテグリカルチャー動物細胞の共培養技術「CulNet System™」(国内外特許)で培養肉・化粧品・皮革の基盤技術を提供。「みんなが使える細胞農業」をビジョンに、CulNetコンソーシアム13社のオープンイノベーションをリード。ユーグレナ(2931、東証プライム)2005年に世界初のユーグレナ(ミドリムシ)屋外培養プール大量培養を実現、2025年12月期売上503.7億円(過去最高)でヘルスケア×バイオ燃料(サステオ)の両輪。ちとせ研究所バイオ産業エコシステム構築者として、マレーシア合流プラント等で広範なバイオ産業化を推進。

3社ともに日本のフードテック・合成生物学の代表格だが、米国・イスラエルとの資金格差「数桁差」という日本の構造的課題も抱える(羽生CEO発言)。
インテグリカルチャー
未上場 | 2015/10/23設立
「培養肉×CulNet System」
羽生雄毅CEO(Shojinmeat Project代表、母体)。東京都文京区本郷。従業員~50人。CulNet System™(国内外特許取得):汎用性高い細胞培養プラットフォーム、動物体内の臓器間相互作用を模擬した環境構築で血清成分内製化・牛胎児血清不要。製品:CELLAMENT®(細胞培養上清液スキンケア原料、2021/4、ユーグレナ採用)、培養フォアグラ、培養毛皮。CulNetコンソーシアム13社(ハウス食品グループ、荏原製作所等)。累計約19億円調達
株式会社ユーグレナ
2931 | 東証プライム
「ミドリムシ×ヘルスケア×バイオ燃料」
東京大学農学部発。2005年12月、世界初の屋外培養プールでのユーグレナ食品用途大量培養成功。連結子会社16社。2025年12月期売上503.7億円(+5.8%、過去最高)、営業利益31.23億円(+938.1%)。時価総額約609億円(2025/10)。3事業:(1)ヘルスケア(ユーグレナ飲料・青汁・サプリ・化粧品、キューサイ含む、CONCブランド)(2)バイオ燃料(SAF「サステオ」、2025/4東急バスHVO51%混合燃料初導入)(3)アグリテック・バイオインフォマティクス・ソーシャル
ちとせ研究所
未上場 | バイオエコシステム
「広域バイオ産業化のオーケストレーター」
バイオ産業エコシステム構築者。マレーシアに合流プラント(藻類培養、バイオジェット燃料等)。ちとせグループとして多様なバイオ企業群を運営。日本発のバイオマス原料活用・カーボンニュートラル社会実装に貢献。NEDO「グリーンイノベーション基金」プロジェクト採択、大型国プロ主導。ユーグレナとも連携(藻類の産業化)。他の2社と比較してより上流の産業インフラ構築に特化
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論点整理 ― 培養肉・藻類・合成生物学の規制・知財

Strategic Context

日本のフードテック市場環境と構造的課題

インテグリカルチャー羽生CEOの指摘(2024年5月TechBlitzインタビュー):「培養肉分野への投資総額で米国やイスラエルと『数桁差』を付けられ、資金が足りずに足踏み状態を強いられているのが実情」。課題の背景には(1)日本企業の未来技術投資への慎重姿勢、(2)国の規制整備の遅れがある。

🔑 フードテック3カテゴリの規制・知財の違い

(1) 培養肉・細胞農業(インテグリカルチャー)
食品衛生法・食品表示法の改正が必要、日本は規制整備遅れ
・シンガポールでは既に培養鶏肉チキンナゲット販売中
CulNet System等の共培養技術は特許化可能(特許取得済み)
・参入障壁:技術+規制+サプライチェーン

(2) 微細藻類食品・バイオ燃料(ユーグレナ)
・既存の食品衛生法・飼料安全法の範囲内で展開可能
バイオ燃料は温対法・ESG規制の追い風
培養技術(屋外培養プール→屋外培養タンク)の特許
・SAF(サステオ)は航空業界のカーボンニュートラル目標に適合

(3) バイオ産業エコシステム(ちとせ研究所)
複数の規制領域(食品・飼料・燃料・素材)にまたがる
・国プロ(NEDO等)の大型支援が中心
プロセス特許・プラットフォーム特許が重要
・参入障壁:エコシステム内の関係構築力

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インテグリカルチャー ― 培養肉のCulNet System

Company Analysis

企業プロファイル

設立
2015/10/23
代表
羽生雄毅CEO
従業員
~50人
累計調達
約19億円
コンソーシアム
13社

インテグリカルチャー株式会社は2015年10月23日設立。本店:東京都文京区本郷4-1-3 7F。CEO羽生雄毅氏は、有志サークル「Shojinmeat Project」(自宅培養肉動画配信から開始、2014年設立)から企業として産業化を担うスピンオフとして法人化。

CulNet System™の革命的技術

「共培養」という特許技術(国内外取得済)
・動物体内の臓器間相互作用(血管で臓器同士がつながり相互作用)を機械の中で再現
フィーダー培養層に肝臓・膵臓細胞を入れて血清成分を作出
ターゲット培養層で筋肉・脂肪細胞を培養
・結果:牛胎児血清・成長因子が不要で基礎培地のみで細胞培養可能(大幅コストダウン)
あらゆる動物細胞を大規模・安価に培養可能(汎用性)
・基礎培地:糖分、アミノ酸、ビタミン、ミネラルの混合物(安価、「根本的にはスポーツドリンクと同じ」羽生氏)

技術的優位性:競合他社は牛・豚・魚など特定動物に特化しているのに対し、CulNet Systemはどんな種類の細胞でも培養可能

インテグリカルチャーの知財戦略

📄 インテグリカルチャーの知財構造
第1層:CulNet System™特許(コア特許)
国内外で特許取得済(「共培養」技術)
・血清成分の内製化、臓器間相互作用の機械的再現

第2層:製品別の派生特許
CELLAMENT®(細胞培養上清液スキンケア原料、2021/4リリース)
・培養フォアグラ量産化技術
・培養毛皮技術

第3層:コンソーシアム・プラットフォーム
CulNetコンソーシアム(2021年設立、13社参画):ハウス食品グループ、荏原製作所等
Uni-CulNet(ユニカルネット):細胞農業統一基盤構想
勝手場(Ocatté Base):BtoBマーケットプレイス

第4層:Shojinmeat Projectとの連携(オープンソース戦略)
・Shojinmeat Projectは培養肉情報をオープンソースで公開(DIYバイオ)
コミュニティ形成と特許事業の両立という独自戦略
【競争優位】インテグリカルチャーの知財が経営戦略にもたらす3つのインパクト

① 13社コンソーシアム構築による「業界標準化」
CulNetコンソーシアム参画企業:ハウス食品グループ(細胞製品加工・安全性基準)、荏原製作所(ポンプ技術)等多様な業界。5分野(標準培養液・実機・生産技術・品質管理・製品加工)で共同開発。これは単なる提携ではなく、CulNet Systemを業界標準化する戦略

② 食料以外の応用による短期収益化
CELLAMENT®(スキンケア原料):ユーグレナ社に採用(本ケースで比較する企業)
ファビウス社(美容ブランド):CELLAMENT®配合「Cell+」発売
・培養毛皮
培養肉は規制整備遅れで上市困難だが、化粧品原料は即座に収益化可能。「化粧品で得た収益を食品に投じる」(羽生CEO)というクロスファンディング戦略

③ 多様な資金調達手段の確保
・シード3億円、シリーズA 8億円(Beyond Next、日本ハム、リアルテック等)
シリーズA' 7.8億円(2022/1、12社):ハウス食品、三井住友信託等
・2024/2横浜キャピタル
2025/2 東京スター銀行ベンチャーデット(「VC調達から銀行取引へ次のステージ」羽生CEO)
2025/10 北國銀行1億円融資
住友理工と戦略的パートナーシップ(細胞農業社会実装)、Inner Resourceと共同プロジェクト
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ユーグレナ ― 東証プライム藻類食品リーダー

Company Analysis

企業プロファイル&財務状況

株式会社ユーグレナは東京大学農学部発、2005年12月に世界初の屋外培養プールでのユーグレナ(ミドリムシ)食品用途大量培養に成功2025年12月期は売上503.7億円(前期比+5.8%)、営業利益31.23億円(+938.1%)と過去最高売上。時価総額約609億円(2025/10時点)。東証プライム上場。連結子会社16社、関連会社2社。

ユーグレナの3事業構造(2025年12月期)

【ヘルスケア事業】主力
・ユーグレナ・クロレラを活用した健康食品、ユーグレナ飲料、青汁、サプリメント、化粧品
子会社キューサイ(青汁)
CONC:次世代エイジングケアブランド、積極投資
・「子どもの栄養サポート」シリーズ2025/4販売好調(適時開示)

【バイオ燃料事業】SAF「サステオ」
マレーシアに合流プラント建設・運営合弁会社(出資完了)
東急バスと2025/4/21、HVO51%混合燃料「サステオ51」を路線バスに国内初導入
・ユーグレナ由来の脂質+産業廃棄油等のバイオマス資源
・温対法・航空カーボンニュートラル目標への対応

【その他事業】
・サステナブルアグリテック
・バイオインフォマティクス
・ソーシャルビジネス(グラミン・ユーグレナ等)

ユーグレナの知財戦略:培養技術+ブランド+多角化

📄 ユーグレナの知財構造
第1層:培養技術の特許ポートフォリオ
屋外培養プール(2005年世界初)
・現在は屋外培養タンク(光従属栄養培養)
独立栄養培養:耕作不適地活用、食糧生産競合回避
従属栄養培養:食糧生産廃棄物原料、食糧競合回避
・大規模化・低コスト化の技術改良特許群

第2層:ユーグレナの独特な生物学的優位性
動物細胞と同様に細胞壁を持たない→他の微細藻類より低コスト・低エネルギーで脂質抽出可能
・これがバイオ燃料原料としての決定的優位性

第3層:ブランド・製品商標
サステオ®(SAF)CONC(エイジングケア)、キューサイ(青汁)等
・カテゴリ別ブランド戦略

第4層:M&A・子会社による知財集約
・連結子会社16社を通じた事業拡大
・バイオジェット燃料子会社「キューサイ」
【競争優位】ユーグレナの知財が経営戦略にもたらすインパクト

① 「世界初の屋外培養大量培養成功」という先行者優位
2005年12月の成功は20年以上にわたる先行優位。競合が同等の培養技術を開発するには、技術的にも実績的にも大きな時間差がある。

② バイオ燃料×ESG×脱炭素の追い風
・2025年営業利益+938.1%の激増バイオ燃料事業の実装化が大きく寄与
東急バスSAF51%混合、マレーシア合流プラントの事業化が進む
・航空業界のカーボンニュートラル目標(2050年)に向けた需要拡大

③ CELLAMENT®採用に見る「業界リーダー認知」
インテグリカルチャーのCELLAMENT®をユーグレナが採用(CONCブランド等)。ユーグレナは自社技術に加え、業界内他社の先進技術も取り込む柔軟な戦略。これは日本フードテック業界の協業モデルの典型。

⚠ ユーグレナの株価動向と課題

・時価総額609億円(2025/10)は、売上503億円に対して1倍強の低い水準
ROE -2.50%、PER 322.8倍という状況
日経ヴェリタス2025/9「ユーグレナ社長、株価反転へ『何でもやる』」と報道
・株主優待・配当の拡大、M&A・事業再編の可能性

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ちとせ研究所 ― バイオ産業エコシステム構築

Company Analysis

企業プロファイル(公開情報ベース)

ちとせ研究所(ちとせグループ)は、日本のバイオ産業エコシステム構築者として知られる。複数のバイオ企業群を束ねるエコシステムモデルが特徴。

ちとせグループの事業領域

マレーシアに合流プラントを有し、藻類培養・バイオマス原料活用・バイオジェット燃料等の大規模実証
NEDO「グリーンイノベーション基金」プロジェクトの採択企業群
東南アジアを主戦場とする日本発バイオ産業化
・ちとせグループとして多様なバイオ企業を運営(藻類、発酵、機能性素材等)
他の2社と比較してより上流の産業インフラ構築に特化

⚠ 注記:ちとせ研究所に関する公開情報の限定性

ちとせ研究所(およびちとせグループ)は非上場企業であり、詳細な資金調達額・特許ポートフォリオ・売上規模・従業員数等の公開情報が限定的です。本ケーススタディでは、業界メディアでの言及・NEDO公開情報・報道・ちとせグループ公式情報に基づき分析を試みましたが、他の2社(インテグリカルチャー、ユーグレナ)と比較して情報の深度は限定的です。

注記:この情報の非対称性は、本レポートの公開情報ベース分析としての限界を示すものです。

ちとせ研究所のポジショニング(推定)

公開情報から読み取れるちとせ研究所の知財戦略の特徴:

【推定される】ちとせ研究所の知財戦略

(1) 大型国プロ(NEDO等)主導のオープンイノベーション
・NEDO「グリーンイノベーション基金」採択で国費による研究開発
・大学・研究機関・事業会社との共同研究主体
・知財は共同出願・国への権利帰属が多い可能性

(2) マレーシア拠点の事業実装優位
・マレーシアの気候条件(赤道近辺、藻類培養に適した日照)規制環境を活用
日本で規制整備が遅れる間にアジア展開で先行する戦略
・現地合弁会社・JV構造での知財設計

(3) エコシステム型事業モデル
・個別技術の特許化より複数企業を束ねるエコシステム全体の価値創造
・プラットフォーム特許+業界標準化+政府支援が三位一体
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3社比較&ポートフォリオマップ

Comparative Matrix

事業・財務・知財の統合比較

評価軸インテグリカルチャーユーグレナちとせ研究所
主要対象動物細胞(培養肉・化粧品)微細藻類(ヘルスケア・燃料)多様バイオ(エコシステム)
上場/未上場未上場東証プライム(2931)未上場(グループ形態)
2024-25年財務累計調達約19億円売上503.7億円、時価609億円非公開
コア特許CulNet System™(国内外取得)屋外培養技術+独立/従属栄養培養プロセス特許(推定)
主要パートナーCulNetコンソーシアム13社、住友理工東急バス、キューサイ、各子会社16社NEDO、大学、東南アジアJV
収益化モデル化粧品原料(CELLAMENT®)→培養肉健康食品(主力)→バイオ燃料国プロ+エコシステム運営
海外展開限定的マレーシア合流プラント、海外研究マレーシア主戦場
競争優位「どんな動物細胞も培養」細胞壁なしで脂質抽出優位エコシステム構築力

事業エリア2Dポートフォリオマップ

X軸:バイオ対象の幅(特定細胞 ← → 多様バイオ)
Y軸:事業成熟度(研究開発 ← → 商業化)
バブルサイズ:事業規模・資金調達

🗺 ポートフォリオマップから読み取れる戦略的含意

(1) 日本フードテック3社の「バリューチェーン分担」
ちとせ研究所(上流:エコシステム基盤)→ インテグリカルチャー(中流:共培養プラットフォーム)→ ユーグレナ(下流:消費者向け製品)という分担構造。3社は相互に連携可能な補完関係

(2) 米国・イスラエルとの「資金格差数桁」の構造的課題
羽生CEO指摘の通り、日本のフードテック投資は米国・イスラエルと桁違いの差。この中でインテグリカルチャー(19億円)、ユーグレナ(上場・時価総額609億円)、ちとせ研究所(国プロ活用)は、異なる方法で資金不足に対応

(3) 知財戦略の多様性
3社とも「特許だけで勝つ」ではなく、(1)コンソーシアム形成、(2)上場による資金調達、(3)国プロ活用という知財を超えた経営資源の総動員で世界競争を戦う。

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追うべきシグナル

Signals
シグナル① インテグリカルチャー培養フォアグラの上市時期
CulNetコンソーシアム13社と共に培養フォアグラの量産化上市を目指す。日本の規制整備と並行して、シンガポール・米国での先行販売の可能性。2026-2027年が正念場。
シグナル② ユーグレナのSAF実装拡大と株価反転
2025/4東急バスSAF51%混合が実装事例。航空業界での採用拡大が焦点。出雲充社長の「何でもやる」宣言(日経ヴェリタス)で、追加M&A・事業再編の可能性。
シグナル③ ちとせ研究所のアジア事業実装
マレーシア合流プラントでの実証が進む。NEDOグリーンイノベーション基金プロジェクトの成果によっては、大型調達・IPOの可能性。